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No Jupiter-web: [[https://uspdigital.usp.br/jupiterweb/obterDisciplina?sgldis=SCC0172&nomdis= Ementa]].



== Avisos ==

* '''Recuperação''':  dia 06 de fevereiro de 2013, 14h. Local:  ICMC sala 3-010. 
As revisões de prova poderão ser feitas a qualquer momento, até o início do 1o. semestre de 2013. Possibilidades: 3 a 14 de janeiro e fevereiro a qualquer momento. Dia 19/12 próximo é também uma possibilidade. Mandar e-mail para a profa. Rosane marcando o horário.
* As notas das avaliações e frequência dos alunos estão disponíveis.
* As notas das atividades [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_7.zip‎|7]], [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_8.zip‎|8]], [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_9.zip‎|9]] e [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_10.zip‎|10]] estão disponíveis. Também foram atualizadas as notas das atividades anteriores. Lembrem de utilizar a senha para abrir os arquivos.
* Para a média serão consideradas as '''7 melhores notas''' de trabalhos práticos.
* Definida '''data da recuperação''':  dia 06 de fevereiro de 2013, 14h. Local a ser definido.
* Estão disponíveis as listas de exercício [[Media:scc0172_Lista04.pdf|04]], [[Media:scc0172_Lista05.pdf|05]] e [[Media:scc0172_Lista06.pdf|06]]. ''Bom trabalho !''
* As notas da avaliação [[Mídia:Progbio_nota_prova_1.zip‎|1]] estão disponíveis. Lembrem de utilizar a senha padrão para abrir o arquivo. A revisão será no dia 19 de novembro, no horário de atendimento.
* As notas da atividade [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_4.zip‎|4]] estão disponíveis. Lembrem de utilizar a mesma senha da atividade anterior para abrir o arquivo.
* As notas das atividades [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_2.zip‎|2]] e [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_3.zip‎|3]] estão disponíveis. Lembrem de utilizar a mesma senha da atividade anterior para abrir os arquivos.
* As notas da atividade [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_1.zip‎|1]] estão disponíveis. Lembrem de utilizar a senha enviada por e-mail para abrir o arquivo.
* Foi adicionado um arquivo com o [[Mídia:Cronograma_e_Avaliação-SCC172_2012-atualizado.pdf|cronograma e avaliação]] atualizados.
* Antes da aula de 30/08: fazer os exercícios da aula Algoritmos II, tema execução condicional, tanto os algoritmos como os programas em Python. Reprogramar, executar e alterar os programas fornecidos para treinamento.
* Antes da aula de 16/08: testar a execução dos comandos do pseudo-código (Aula Algoritmos I) em Python, e fazer os exercícios do último slide da aula Algoritmos I.

* '''Quinta-feira''' dia '''16/08/2012''' prática no '''Lab 206'''. Fazer a lista de exercícios antes.

* [[Mídia:Avalia.pdf‎|Cronograma e Avaliação disponíveis]]

* '''Atenção:''' os exercícios referentes a aula do dia '''09/08/2012''' estão disponíveis.

* '''Quinta-feira''' dia '''02/08/2012''' a aula será teórica na '''sala:''' [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-anfiteatros.jpg Anf. H. Panepucci]



== Divulgação de Notas  ==

'''OBS:''' Utilizem a ''senha'' para visualizar as notas.

'''Trabalhos:'''

* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_1.zip‎|Trabalho Prático 1 - Expressões, Entrada, Saída e Condicional]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_2.zip‎|Trabalho Prático 2 - Estruturas de Controle]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_3.zip|Trabalho Prático 3 - Estruturas de Controle 2]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_4.zip|Trabalho Prático 4 - Funções]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_5.zip|Trabalho Prático 5 - Funções 2]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_6.zip|Trabalho Prático 6 - Vetores]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_7.zip|Trabalho Prático 7 - Matrizes]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_8.zip|Trabalho Prático 8 - Cadeias e Registros]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_9.zip|Trabalho Prático 9 - Alinhamento]]
* [[Mídia:Progbio_nota_trabalho_pratico_10.zip|Trabalho Prático 10 - Busca e Indexação]]

'''Provas:'''

* [[Mídia:Progbio_nota_prova_1.zip‎|Prova 1]]
* [[Mídia:Progbio_nota_prova_2.zip‎|Prova 2]]
* [[Mídia:SCC0172-NotasRec.pdf‎|Rec]]

'''Frequência:'''

* [[Mídia:Progbio_freq.zip‎|Frequência no Semestre]]

== Localização ==

'''Salas:'''
* '''Lab 206 - IFSC''' - [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-206.jpg Laboratório de Ensino] (''Aula Prática e Atendimento'')
* '''Lab 1-007 ICMC''' - [https://www.dropbox.com/s/o8pnerghhnry0ww/mapa-sala-1007.jpg VICG] - [http://infoserver.lcad.icmc.usp.br/infovis2 Laboratório de Pesquisa] (''Atendimento'')
* '''Sala 4-206 ICMC''' - [https://www.dropbox.com/s/s3fftnrdtx0h3f7/mapa-sala-4206.jpg Sala Professora] (''Atendimento'')

'''Anfiteatros:'''
* '''Anf. Verde IFSC''' - [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-anfiteatros.jpg Anfiteatro Verde] (''Aula Teórica'')
* '''Anf. H. Panepucci(Azul) IFSC''' - [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-anfiteatros.jpg Anfiteatro H. Panepucci(Azul)] (''Aula Teórica'')



== Informações da Disciplina ==

'''SCC-0172 - Introdução à Programação para Biologia Molecular'''


'''Professora:''' Rosane Minghim ([mailto:rminghim@icmc.usp.br rminghim@icmc.usp.br])

'''Alunos PAE:''' Carlos Elias Arminio Zampieri ([mailto:ceaz@icmc.usp.br ceaz@icmc.usp.br])
e Renato Rodrigues Oliveira da Silva ([mailto:rros@icmc.usp.br rros@icmc.usp.br])

'''Monitor:''' Gustavo Schimiti ([mailto:gustavo.shimiti@usp.br gustavo.schimiti@usp.br])



== Horários ==

'''Aulas:'''
* '''Terça-feira''' - 16:20 às 18:00 - '''Sala:''' [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-anfiteatros.jpg Anf. Verde] (''Aula Teórica'')
* '''Quinta-feira''' - 16:20 às 18:00 - '''Sala:''' [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-anfiteatros.jpg Anf. H. Panepucci(Azul)] (''Aula Teórica'') ou '''Sala:''' [https://www.dropbox.com/s/nmhuy1rou2qcfa1/mapa-sala-206.jpg 206] (''Aula Prática'')

'''Atendimentos:'''
* '''Profª Drª Rosane''' - Segunda-feira das '''16:00''' às '''19:00''' - ''Sala:'' [https://www.dropbox.com/s/s3fftnrdtx0h3f7/mapa-sala-4206.jpg 4206]

* '''Carlos''' ou '''Renato''' - Quinta-feira das '''14:00''' às '''16:00''' - ''Sala:'' [https://www.dropbox.com/s/o8pnerghhnry0ww/mapa-sala-1007.jpg 1007](o atendimento será transferido para a ''sala:'' [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-206.jpg 206] caso o número de alunos exceda a capacidade da ''sala:'' [https://www.dropbox.com/s/o8pnerghhnry0ww/mapa-sala-1007.jpg 1007]) - Horários adicionais devem ser combinados por e-mail

* '''Gustavo''' - Segunda-feira e Quinta-feira das '''19:00''' às '''21:00''' - ''Sala:'' [https://www.dropbox.com/s/qu2rf2e724it57p/mapa-sala-206.jpg 206]



== Cronograma e Avaliação==

* [[Mídia:Avalia.pdf‎|Cronograma e Avaliação]]
** [[Mídia:Cronograma_e_Avaliação-SCC172_2012-atualizado.pdf|Cronograma e Avaliação Atualizados]]



== Material Didático ==

* [[Mídia:InstalacaoPython.pdf‎|Instalação Python]]
* [https://www.dropbox.com/s/w26mcc70n0xk18w/1-%20historia-computador2012.pdf História do Computador]
* [[Mídia:O_sistema_computacional.pdf‎|O Sistema Computacional]]
* [[Mídia:Algoritmos1.pdf‎|Algoritmos I]]
* [[Mídia:Algoritmos2.pdf‎|Algoritmos II - provisorio, não imprima ainda]]
** [[Mídia:codigos_if_aula.zip|Codigos Python condicional]]
* [[Mídia:Algoritmos2_controle.pdf‎|Estruturas de Controle - Algoritmo - fazer todos os exercícios]]
** [[Mídia:Algoritmos2_controle_python.pdf|Estruturas de Controle - tradução para Python]]
** [[Mídia:codigos_controle_praticaI_e_repeticao.rar|Enunciado e resolução da Prática I, incluindo modificações da aula de 12_09]]
** [[Mídia:pratica2_enunciado.pdf|Enunciado da Prática II]]
** [[Mídia:codigos_pratica3_e_funcoesI.rar|Códigos e Algoritmos da aula de 25.09 - Prática III e Funções I]]
** [[Mídia:funcoes.rar|Slides Funções - Algoritmos e Python]]
* [[Mídia:Scc0172_vetores.pdf‎|Vetores (provisório)]]
** [[Mídia:scc0172_codigos_aula_vetores.zip|Códigos em Python da aula de 23/10]]
** [[Mídia:scc0172_pratica06.zip|Prática VI (enunciado + resolução)]]
* [[Mídia:Scc0172_matrizes.pdf‎|Matrizes (provisório)]]
** [[Mídia:Scc0172_exemplos_matrizes.zip‎‎|Códigos em Python da aula de 06/11]]
** [[Mídia:Scc0172_pratica07.zip|Prática VII (enunciado + resolução)]]
* [[Mídia:Scc0172_cadeias.pdf|Cadeias de Caracteres (provisório)]]
** [[Mídia:Scc0172_exemplos_cadeias.zip‎‎|Códigos em Python da aula de 13/11]]
* [[Mídia:scc0172_namedtuples_2012.pdf|Registros (namedtuple)]]
** [[Mídia:Scc0172_exemplo_registros.zip|Códigos em Python da aula de 20/11]]
* [[Mídia:Scc0172_alinhamento_cadeias.pdf‎|Alinhamento de cadeias]]
** [[Mídia:scc0172_10.1_alinhamento_genetico.pdf‎|Alinhamento de cadeias geneticas]]
* [[Mídia:Busca_e_indice.pdf‎|Busca e Índice de Busca]]
** [[Mídia:Scc0172_exemplo_vusca.zip|Código em Python da aula de 04/12]]

== Lista de Exercícios ==

* [https://www.dropbox.com/s/qvomezlf0jskth2/Exercicios_01.pdf Exercícios 01 - Operações Aritméticas Simples e Strings em Python]
* [[Media:scc0172_Lista02.pdf|Exercícios 02 - Estruturas de Controle Condicionais]]
* [[Media:scc0172_Lista03.pdf|Exercícios 03 - Estruturas de Controle Iterativas]]
* [[Media:scc0172_Lista04.pdf|Exercícios 04 - Vetores]]
* [[Media:scc0172_Lista05.pdf|Exercícios 05 - Matrizes]]
* [[Media:scc0172_Lista06.pdf|Exercícios 06 - Cadeia de Caracteres]]



== Submissão de Trabalhos ==

* Site: [http://tidia-ae.usp.br/portal Tidia-AE]
** [[Mídia:Tidia-ae.pdf‎|Apresentação Tidia-AE]]
** [[Mídia:Escaninho_Tidia-ae.pdf‎|Usando o Escaninho do Tidia-AE]]



== Material Didático Complementar ==
* [http://java.icmc.usp.br/moodle/course/view.php?id=24 Página da Disciplina Ministrada pelo Profº Dilvan em 2011]
* [https://www.dropbox.com/s/ryns3o0tyjeh8y1/python_para_desenvolvedores.pdf Python para Desenvolvedores - 1ª Edição]
* [https://www.dropbox.com/s/67a36b9h7bus9py/python_para_desenvolvedores_2ed.pdf Python para Desenvolvedores - 2ª Edição]
* [[Mídia:ThinkPython.pdf‎|Think Python]]



== Bibliografia Principal ==

'''Livros Texto:'''
* MARK LUTZ, Programming Python (Third Edition), O'Reilly & Associates, 2006.


'''Bibliografia Complementar:'''
* GIBAS, C.; JAMBECK, P.: Desenvolvendo Bioinformática, Editora Campus, 2002.
* KATJA SCHUERER, CATHERINE LETONDA, Python course in Bioinformatics, Programming Course for Biologists at the Pasteur Institute.
* SZWARCFITER, J.L.; MARKEZON, L. - Estruturas de Dados e seus Algoritmos - LTC Editora, 1994.



== Links Interessantes ==

* [http://docs.python.org/index.html# Documentação Python 2.7.3]